Vierzehn Tage vor Urbans Wahl fiel das Lateinische Reich von Konstantinopel , das während des unglückseligen Vierten Kreuzzugs gegen die Byzantiner gegründet wurde, an die Byzantiner unter der Führung von Kaiser Michael VIII. Palaiologos . Urban IV. bemühte sich erfolglos, einen Kreuzzug zur Wiederherstellung des Lateinischen Reiches anzuzetteln.

Urban begann 1262 mit dem Bau der Basilika St. Urbain, Troyes .

Das Fest Fronleichnam ("der Leib Christi") wurde von Urban am 11. August 1264 mit der Veröffentlichung der päpstlichen Bulle Transiturus eingeführt. Urban bat Thomas von Aquin , den dominikanischen Theologen, die Texte für die Messe und das Festmahl zu schreiben. Dazu gehörten so berühmte Hymnen wie Pange lingua, Tantum ergo und Panis angelicus .

Urban wurde in die Angelegenheiten Dänemarks verwickelt . Jakob Erlandsen , Erzbischof von Lund , wollte die dänische Kirche von der königlichen Macht unabhängig machen – was ihn in eine direkte Konfrontation mit der Königinwitwe Margaret Sambiria brachte , die als Regent für ihren Sohn, König Eric V. von Dänemark, fungierte . Die Königin verhaftete den Erzbischof, der darauf mit einem Interdikt reagierte . Beide Seiten versuchten, die Unterstützung des Papstes zu bekommen. Der Papst stimmte mehreren Punkten zu, die die Königin wollte – insbesondere erließ er eine Dispensdie Bedingungen der dänischen Erbfolge zu ändern, die es Frauen ermöglichen würden, den dänischen Thron zu erben. Die Hauptfragen blieben jedoch durch Urbans Tod ungelöst, da der Fall am päpstlichen Hof in Rom weitergeführt wurde und der im Exil lebende Erzbischof Erlandsen nach Italien kam, um ihn persönlich zu verfolgen.

Tatsächlich waren die verworrenen Angelegenheiten des fernen Dänemarks für den Papst nur von untergeordneter Bedeutung. Es war Italien , das Urban in der Nähe volle Aufmerksamkeit geboten: die lange Auseinandersetzung mit der späten Staufer Kaiser Friedrich II während des milden Pontifikats von Alexander IV gedrückt hatte nicht, während die er in zwischen den Städten Kämpfe zwischen nominell prokaiserlichen dezentralisierten Ghibellinen und sogar nominell pro-päpstliche Welfenfraktionen . Der Erbe Friedrichs II., Manfred, war in diese Kämpfe versunken.

Urbans militärischer Hauptmann war der Condottiere Azzo d' Este , der nominell an der Spitze einer lockeren Liga von Städten stand, zu denen Mantua und Ferrara gehörten . Jeder Staufer in Sizilien musste Ansprüche auf die Städte der Lombardei haben , und als Scheck für Manfred führte Urban Karl von Anjou in die Gleichung ein, die Krone des Königreichs Sizilien in die Hände eines Monarchen zu legen, der der päpstlichen Kontrolle zugänglich war. Charles war von seiner Frau her Graf der Provence und unterhielt eine reiche Basis für die Planung eines teuren italienischen Krieges.

Zwei Jahre lang verhandelte Urban mit Manfred darüber, ob Manfred den Lateinern bei der Wiedererlangung Konstantinopels helfen würde, als Gegenleistung für die päpstliche Bestätigung der staufischen Rechte im Reich. Inzwischen verfestigte sich das päpstliche Pakt mit Charles ein Versprechen der päpstlichen Schiffe und Männern durch eine Kreuzzugs produziert Zehnte , und Charles Versprechen nicht Ansprüche auf Imperial lag landet in Norditalien, noch in den Kirchenstaat . Karl versprach, die jährliche Volkszählung oder den feudalen Tribut, der dem Papst als Oberherr zusteht, wieder herzustellen , wobei etwa 10.000 Unzen Gold vereinbart wurden, während der Papst daran arbeiten würde, Konradin von der Wahl zum König der Deutschen zu blockieren .

Vor der Ankunft seines Kandidaten Karl in Italien starb Urban IV. am 2. Oktober 1264 in Perugia. Sein Nachfolger wurde Papst Clemens IV. , der sofort die päpstliche Seite des Arrangements übernahm.

Es gibt eine Geschichte, dass der Tod des Papstes mit dem Großen Kometen von 1264 zusammenhängt, an dem er irgendwann bei der Ankunft des Kometen erkrankte und dann starb, als der Komet verschwand.